Les zoonoses, infections transmissibles entre les animaux et les humains, constituent un défi sanitaire mondial croissant, en particulier dans les régions où les populations vivent en contact étroit avec la faune sauvage. La compréhension de ces interactions est au cœur de l'approche « One Health ».
HIOH et ses partenaires ont récemment lancé leur première cohorte Une Seule Santé, une initiative unique, dans et autour du parc national de Taï, en Côte d'Ivoire, dans le cadre des Exploratoires One Health (One Health Exploratories). Coordonné par le groupe de recherche “One Health Surveillance” de HIOH, cet effort de long terme vise à approfondir notre compréhension des liens entre la santé humaine, animale et environnementale afin de détecter rapidement les événements de propagation potentiels et de renforcer la préparation aux futures pandémies.
Dans le cadre de cette initiative, nos équipes interagiront avec 1 500 personnes vivant dans les villages autour du parc. L'étude sera mise en œuvre avec l'aide d'une cinquantaine de collaborateurs ivoiriens sur place. Des centres d'examen temporaires seront mis en place pour examiner les participants humains, collecter des échantillons et mener des questionnaires structurés. En parallèle, des équipes vétérinaires prélèveront des échantillons sur des animaux domestiques et d'élevage, tandis qu’une équipe spécialisée dans l’étude des petits mammifères prélèvera des échantillons chez les rongeurs et les chauves-souris au sein des villages. Ce travail sera complété par un programme complet de surveillance environnementale, comprenant des prélèvements d'eau et des études sur la biodiversité. Au total, 15 membres du personnel HIOH seront déployés en Côte d'Ivoire entre la mi-février et la fin mai 2026.
Cette initiative s'appuie sur la présence de longue date de HIOH dans la région et sur des années de travail préparatoire conjoint entre HIOH, le Centre Hospitalier Universitaire (CHU) de Bouaké, le Centre Suisse de Recherches Scientifiques (CSRS), le Centre Helmholtz pour la recherche sur les infections (Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung, HZI) et l'Institut Friedrich Loeffler (Friedrich-Loeffler-Institut, FLI). Ensemble, nous avons élaboré le protocole de l'étude à travers une série d'ateliers collaboratifs et de longs séjours sur le terrain.
Les échantillons et les données générés grâce à cet effort unique au monde offriront de nouvelles opportunités pour mieux comprendre l'émergence des zoonoses et de la résistance antimicrobienne, tout en ouvrant de nouvelles voies pour la recherche et la coopération.
Grâce à ce blog, lancé en janvier 2026, nous vous tiendrons informés des préparatifs et des progrès réalisés sur le terrain.
Équipe d'examen médical: le personnel médical ivoirien et allemand gère les centres d'examen
Équipe chargée des questionnaires: des membres de la communauté et des sociologues mènent des enquêtes au niveau des ménages et des participants individuels
Équipes vétérinaires: trois équipes composées de vétérinaires ivoiriens et allemands expérimentés prélèvent des échantillons sur le bétail, tandis qu'une quatrième équipe se concentre sur les petits mammifères et les prélèvements environnementaux
Équipe de laboratoire: traite tous les échantillons dans le laboratoire de terrain
Équipe de gestion des données: soutient toutes les étapes du processus, de la collecte des données et des échantillons à leur stockage sécurisé
Équipe de coordination sur le terrain: les experts One Health du CHU de Bouaké, du CSRS et du HIOH font office de points focaux pour toutes les autres équipes, veillant à ce que toutes les pièces du puzzle s'assemblent à la fin
Le prélèvement d’échantillons sur le bétail et les animaux domestiques se poursuit à Keibly, où l’on observe généralement des troupeaux bovins plus importants que dans les autres villages participant au programme.
Keibly est le plus grand village participant à l’étude et, en même temps, le plus éloigné du laboratoire de terrain. Malgré les difficultés logistiques rencontrées par l’équipe, le travail y a démarré dans la bonne humeur. Au centre d’examen temporaire, des prélèvements d’échantillons sont effectués, ainsi que des examens de la vue, des mesures de la tension artérielle, des spirométries, des oxymétries de pouls, des mesures du poids et de la taille, ainsi que des questionnaires. À Keibly, les examens sont réalisés auprès de 415 participants sur une population totale de 10 014 habitants.
Avec l'arrivée progressive de la saison des pluies, qui s'accompagne de nouveaux défis, les coupures de courant sont de plus en plus fréquentes. Le laboratoire est donc raccordé à un générateur, ce qui permet de faire fonctionner tous les appareils en cas de panne du réseau électrique public.
Notre coordinateur Filipe, en compagnie d'une partie du personnel du centre d'examen temporaire de Zaipobly. Ici aussi, des analyses environnementales supplémentaires ont été effectuées, et des échantillons ont été prélevés sur des rongeurs, des chauves-souris, ainsi que sur des animaux domestiques et d'élevage – la deuxième photo montre Filipe en train de prélever un échantillon sur une tortue. Zaipobly, 5e village – mission accomplie!
Dans le cadre de la surveillance environnementale, Jasmin prélève des échantillons d'eau à Gouléako, tandis qu'Olivier et René, le coordinateur, capturent des mouches et que Jesselyn prélève des échantillons de sol.
Piégeage des chauves-souris : Léonce et Ayé, accompagnés des responsables Pâcome et D’Avila de l’équipe « Petits mammifères et environnement », préparent et installent un filet japonais à Gouléako, troisième village participant à l’étude. Des échantillons de chauves-souris et de rongeurs sont prélevés trois nuits par semaine pendant toute la durée de l’étude.
Les trois équipes vétérinaires se rendent chez les habitants de Paulé-Oula pour prélever des échantillons sur les animaux domestiques.
Impressions de l'équipe du laboratoire: préparation des échantillons prélevés auprès de la première vague de participants. Ces échantillons feront ensuite l'objet de tests de dépistage de divers agents pathogènes au CHU de Bouaké et à l'HIOH.
L'équipe « Petits mammifères et environnement » a commencé ses travaux à Paulé-Oula. Elle procède au piégeage de rongeurs et de chauves-souris dans les foyers, effectue des prélèvements sur les surfaces aux points de contact entre les humains et les animaux à l'intérieur des habitations, capture des mouches pour surveiller la biodiversité et prélève des échantillons d'eau afin de détecter une éventuelle résistance aux antibiotiques.
Le grand jour ! Trois voitures sont chargées de tout le matériel nécessaire au centre d’examen ainsi qu’aux équipes vétérinaires et environnementales. C’est parti ! Voici quelques impressions sur place.
Aujourd’hui, nous nous sommes rendus à Paulé-Oula pour organiser le lancement de l’étude de cohorte. Il s’agit du premier village où nous mettrons en place l’ensemble du programme, comprenant :
un centre d’examen (module humain)
des examens vétérinaires mobiles (module animaux de compagnie)
des prélèvements sur les petits mammifères
des prélèvements environnementaux
Une formation a été dispensée tant au personnel médical travaillant dans les centres d'examen qu'aux équipes vétérinaires, y compris à tous les membres de ces équipes (infirmiers, vétérinaires, assistants et recenseurs).
Vous pouvez voir ici le nouveau laboratoire de terrain de Taï, mis en place en partenariat avec la Direction départementale de la santé.
Notre système électrique pour le laboratoire HIOH est désormais prêt à prendre en charge tous les appareils destinés à l'analyse d'échantillons humains, animaux et environnementaux.
Les enquêteurs (équipe chargée des questionnaires) se sont rendus dans les foyers pour mener les enquêtes et recruter des participants.
Nettoyage des pièges à rongeurs — ça fait aussi partie du travail. Grâce aux pièges vivants, nous pouvons capturer les animaux en toute sécurité, prélever des échantillons de manière peu invasive, puis les relâcher.
Le laboratoire de terrain est prêt à démarrer ! Avant le traitement des premiers échantillons, tout est rangé et préparé. Pour rendre cela possible, le HIOH a auparavant rénové les locaux en collaboration avec l’hôpital local et y a installé son propre laboratoire.
Des membres des communautés, des autorités locales et l’équipe de la cohorte HIOH se sont réunis aujourd’hui à Taï pour un atelier avec les parties prenantes sur les interactions homme-faune, axé sur l’importance d’un engagement continu pour prévenir les zoonoses – la presse ivoirienne a déjà couvert l’événement.
Chargement des derniers matériaux pour l’étude de cohorte, prêts à être transportés à Taï. Certains équipements et consommables ont été achetés localement, d’autres proviennent de notre stockage permanent à Abidjan ou ont été livrés depuis l’Allemagne — un processus de plusieurs mois de préparation minutieuse.
Une étape majeure : le recrutement des participants a commencé aujourd’hui ! Nos équipes visitent désormais les foyers préalablement sélectionnés dans neuf villages autour du parc national de Taï. Dans chaque foyer, trois à quatre habitants sont invités à rejoindre la cohorte, soit 1 500 volontaires au total. Chaque visite est accompagnée de formulaires de consentement, de questionnaires et d’une documentation rigoureuse. Beaucoup de paperasse – mais une base essentielle pour une recherche de qualité.
En raison de retards liés aux conditions météorologiques à l’aéroport de Berlin, notre vol a été reporté à demain. Mais le moral reste au beau fixe et nous sommes prêts à partir !
Des membres des communautés de différents villages – formés comme enquêteurs et points focaux – mèneront des entretiens avec les participants de la cohorte, aux côtés des scientifiques sociaux. Aujourd’hui, ils ont terminé leur formation, prêts pour le début du recrutement la semaine prochaine.
Tout est prêt pour le recrutement des participant·e·s : formulaires de consentement, tubes d’échantillons et tablettes pour les questionnaires, ainsi que les batteries externes entièrement chargées. Au total, 1 500 volontaires issus de neuf villages participeront à l’étude. À partir de demain, nos équipes visiteront les ménages sélectionnés selon une approche de type « random walk » pour recruter trois à quatre personnes par foyer.
Notre affiche d’information sur l’étude de cohorte est déjà visible partout où nous nous rendons. Ici, par exemple, à l’Hôpital Général de Taï (à gauche) et au bureau régional du Ministère des Ressources Animales et Halieutiques à Guiglo (MIRAH, à droite).
Nos propres portoirs à tubes imprimés en 3D pour les besoins spécifiques de la cohorte sont prêts ! Le stockage des échantillons dans des tubes de biobanque étiquetés par code QR facilitera grandement le tri et les analyses futures.
