En 2016, la vétérinaire et microbiologiste Katharina Schaufler a obtenu son doctorat (Dr. med. vet. et PhD) sur le thème de la résistance aux antibiotiques sous la supervision experte du professeur Lothar H. Wieler à l'Université libre de Berlin. Son parcours universitaire dans le cadre d'une bourse de recherche Alexander von Humboldt l'a conduite à la Harvard Medical School de Boston, où elle a acquis une expérience précieuse sous la direction du professeur Michael S. Gilmore. En tant que microbiologiste, elle a été nommée professeure junior de microbiologie pharmaceutique à l'université de Greifswald en 2019 et a obtenu avec succès le groupe de recherche junior BMBF « DISPATch_MRGN » en novembre 2020, doté de plus de deux millions d'euros. En 2021, elle a accepté l'appel de l'université Christian-Albrechts de Kiel, où elle s'est consacrée à la microbiologie médicale. Depuis mi-2023, elle est directrice du département « Épidémiologie et écologie de la résistance aux antimicrobiens » à l’Institut Helmholtz One Health ainsi que professeure à la médecine universitaire de Greifswald.

Katharina Schaufler est une scientifique expérimentée dans le domaine de la résistance aux antimicrobiens et fait partie intégrante d'un réseau international d'experts. Ses activités de recherche s'inscrivent dans l'approche holistique One Health, qui utilise des méthodes de pointe en bioinformatique et en biologie moléculaire pour poursuivre l'objectif global d'avoir une vision globale de la santé humaine, animale et environnementale. L'accent est mis non seulement sur l'élucidation des mécanismes fondamentaux du développement et de la transmission des maladies infectieuses, mais aussi sur le développement de stratégies alternatives pour lutter contre les agents pathogènes résistants aux antibiotiques. Pour concrétiser sa vision de la recherche, elle obtient un grand nombre de projets financés par des tiers, remporte des prix et publie ses découvertes scientifiques dans des revues renommées.

La professeure Schaufler dirige le module « One Health und Antimicrobial Resistance » (One Health et résistance aux antimicrobiens) dans le cadre du programme de master « Infection Biology and Immunology » (Biologie infectieuse et immunologie) de l'université de Greifswald. Ce module combine des contenus théoriques et des applications pratiques sous forme de séminaires et de stages afin de favoriser une compréhension globale de la résistance aux antimicrobiens dans le cadre de l'approche One Health.

Sélection de publications

Katharina Schaufler, Nicola Schmidt, Michael Schwabe, Stefan E Heiden, Helmut Fickenscher, Pei Yee Woh, Sy Bui Tien, Thirumalaisamy P Velavan, Le Huu Song, Bernd Neumann, Evgeny A Idelevich, Karsten Becker, Andi Krumbholz, Kaan Kocer, Sébastien Boutin, Dennis Nurjadi, Elias Eger, Rethinking virulence screening in Klebsiella pneumoniae: a case for a standardised Galleria mellonella infection model,
The Lancet Microbe, 2026, 101421, ISSN 2666-5247, DOI: 10.1016/j.lanmic.2026.101421.

Schaufler K, Schmidt N, Schwabe M, Heiden SE, Fickenscher H, Who PY, Tien SB, Velavan TP, Song LH, Neumann B, Idelevich EA, Becker K, Krumbholz A, Kocer K, Boutin S, Nurjadi D, Eger E. Rethinking virulence screening in Klebsiella pneumoniae: A case for a standardized Galleria mellonella infection model. The Lancet Microbe. 2026

Müller JU, Eger E, Jana B, Schwabe M, Nurjadi D, Ma Y, Pirolo M, Guardabassi L, Schaufler K. The hidden link between cefiderocol resistance and increased virulence in Klebsiella pneumoniae: insights from a transposon-directed insertion-site sequencing-based investigation. Clin Microbiol Infect. 2026. 32(4):603-609. DOI: 10.1016/j.cmi.2025.12.010

Echelmeyer T, Ellmann M, Heiden SE, Kocer K, Schwabe M, Fickenscher H, Maschkowitz G, Guenther S, Nurjadi D, Schaufler K, Eger E. Novel continuous experimental evolution methodology uncovers rapid resistance development and cross-resistance. npj Antimicrob Resist. 2026. 4(1):18. DOI: 10.1038/s44259-026-00191-x

Swiatek LS, Eger E, Surmann K, Meller F, Schulig L, Harms M, Echelmeyer T, Hentschker C, Völker U, Schwabe M, Schaufler K. Genomic and functional characterization of the L-sorbose phosphotransferase system in high-risk Escherichia coli lineages. mSystems. 2026. 11(1):e0127425. DOI: 10.1128/msystems.01274-25

Wende M, Osbelt L, Eisenhard L, Lesker TR, Damaris BF, Mutukumarasamy U, Bielecka A, d. H. Almási É, Winter KA, Schauer J, Pfennigwerth N, Gatermann S, Schaufler K, Schlüter D, Galardini M, Strowig T. Suppression of gut colonization by multidrug-resistant Escherichia coli clinical isolates through cooperative niche exclusion. Nature Commun. 2025. 16(1):5426. DOI: 10.1038/s41467-025-61327-7

Lübcke P, Heiden SE, Homeier-Bachmann T, Bohnert JA, Schulze C, Eger E, Schwabe M, Guenther S, Schaufler K. Multidrug-resistant high-risk clonal Escherichia coli lineages occur along an antibiotic residue gradient in the Baltic Sea. npj Clean Water. 2024. 7:94. DOI: 10.1038/s41545-024-00394-7

Eger E, Homeier-Bachmann T, Adade E, Dreyer S, Heiden SE, Lübcke P, Tawiah PO, Sylverken AA, Knauf S, Schaufler K. Carbapenem- and cefiderocol-resistant Enterobacterales in surface water in Kumasi, Ashanti Region, Ghana. JAC Antimicrob Resist. 2024. 6(2):dlae021. DOI: 10.1093/jacamr/dlae021

Schaufler K, Echelmeyer T, Schwabe M, Guenther S, Bohnert JA, Becker K, Fickenscher H, Bueter A, Maschkowitz G, Krumbholz A, Nurjadi D, Heiden SE, Eger E. Convergent Klebsiella pneumoniae strains belonging to a sequence type 307 outbreak clone combine cefiderocol and carbapenem resistance with hypervirulence. Emerg Microbes Infect. 2023. 12(2):2271096. DOI: 10.1080/22221751.2023.2271096

Shaidullina ER*, Schwabe M*, Rohde T, Shapovalova VV, Dyachkova MS, Matsvay AD, Savochkina YA, Shelenkov AA, Mikhaylova YV, Sydow K, Lebreton F, Idelevich EA, Heiden SE, Becker K, Kozlov RS, Shipulin GA, Akimkin VG, Lalk M, Guenther S, Zautner AE, Bohnert JA, Mardanova AM, Bouganim R, Marchaim D, Hoff KJ, Schaufler K*, Edelstein MV*. Genomic analysis of the international high-risk clonal lineage Klebsiella pneumoniae sequence type 395. Genome Med. 2023. 15(1):9. DOI: 10.1186/s13073-023-01159-6

Heiden SE*, Hübner NO*, Bohnert JA, Heidecke CD, Kramer A, Balau V, Gierer W, Schaefer S, Eckmanns T, Gatermann S, Eger E, Guenther S, Becker K, Schaufler K. A Klebsiella pneumoniae ST307 outbreak clone from Germany demonstrates features of extensive drug resistance, hypermucoviscosity, and enhanced iron acquisition. Genome Med. 2020. 12(1):113. DOI: 10.1186/s13073-020-00814-6