Lorenzo Lagostina est biologiste moléculaire de formation, animé par le désir de mieux comprendre les interactions entre le monde microbien et les dynamiques écologiques à l’échelle des écosystèmes — et la manière dont la vie et l’environnement se façonnent continuellement l’un l’autre. Au cours de son doctorat en microbiologie environnementale à l’ETH Zurich, il a étudié les facteurs environnementaux structurant les communautés microbiennes dans des échantillons de sédiments océaniques à faible biomasse, en utilisant des approches statistiques multivariées.

La pression croissante exercée sur les ressources naturelles et la crise actuelle de la biodiversité l’ont amené à s’intéresser à la manière dont les changements environnementaux d’origine anthropique modifient la structure des communautés animales ainsi que leurs communautés virales et microbiennes associées. Ses recherches portent sur la manière dont l’altération des habitats influence la distribution et la diversité des petits mammifères — en particulier les chauves-souris et les petits mammifères terrestres — et, par conséquent, comment ces changements affectent la présence et la propagation d’agents infectieux. Son approche consiste à étudier des systèmes naturels pouvant servir de laboratoires paysagers, en exploitant les modifications induites par l’activité humaine pour mieux comprendre les processus écologiques qui régissent les événements de spillover.

En 2020, il a rejoint le groupe de Fabian Leendertz à l’Institut Robert Koch afin d’explorer directement ces questions. Il y a coordonné les activités du projet BIODIV-AFREID en Côte d’Ivoire, où, avec le Dr Leonce Kouadio, il a mis en place et dirigé quatre années consécutives d’échantillonnage de terrain (de 2021 à 2024 — petits mammifères et échantillons environnementaux) dans le parc national de Taï et dans les villages environnants. Lorsque le groupe a rejoint le nouvel Institut Helmholtz pour One Health, il a continué à coordonner les activités de terrain et de laboratoire dans le cadre du projet BCOMING.

Au cœur de ces travaux se trouve une question conceptuelle fondamentale : la biodiversité est largement utilisée comme indicateur de la santé environnementale, mais des écosystèmes plus diversifiés ne sont pas nécessairement plus sûrs du point de vue du risque zoonotique. Dans quelle mesure les indices de biodiversité existants permettent-ils réellement de saisir les dimensions de la santé environnementale les plus pertinentes ? Son travail aborde ces questions de manière critique — en comparant différents indices, en adaptant les méthodes d’échantillonnage aux questions de recherche et aux communautés cibles, et en examinant si nos indicateurs actuels sont véritablement adaptés à leur objectif.

Avec la Dre Livia Patrono, il est responsable de l’Output IV du projet INFORBIO financé par le BMBF — une initiative hautement interdisciplinaire dirigée par WWF Allemagne visant à améliorer les moyens de subsistance des communautés locales autochtones dans des zones reculées du Cameroun et de la République centrafricaine, où l’Institut Helmholtz pour One Health est chargé de mettre en place un système d’alerte précoce pour les zoonoses.

Il dirige également les volets de terrain et de laboratoire du projet « BehaviorChange » financé par la VolkswagenStiftung — une collaboration avec l’École vétérinaire de Dakar, l’Université d’Abidjan et le musée Senckenberg de Görlitz, entre autres — visant à caractériser la consommation de viande de brousse et les agents infectieux associés en Côte d’Ivoire et au Libéria, en utilisant des approches basées sur l’eDNA.